SMP Negeri 6 Makassar terletak di lokasi yang sangat strategis di jantung kota Makassar tepatnya di jalan Jenderal Ahmad Yani no. 25 Makassar. Sekolah ini merupakan salah satu dari 4 Sekolah Standar Nasional di Makassar dan satu-satunya Sekolah Koalisi Nasional di Sulawesi selatan.
Empat puluh enam tahun silam tepatnya pada tanggal 25 Oktober 1960 Pemerintah mengeluarkan keputusan pendirian SMP 6 sebagai salah satu sekolah negeri di kotamadya Ujung Pandang dengan SK nomor : 355/SK/BIII. Bapak Drs. Rajuni merupakan Pejabat sementara kepala sekolah mulai membina sekolah tersebut dengan dibantu 27 orang guru dan 2 staf Tata usaha serta ruang kelas sebanyak 5 lokal. Karena lokasi awal SMP negeri 6 terlalu sempit untuk mengembangkan dan melengkapi sarana prasarana sekolah maka, beberapa waktu kemudian Panglima KODAM Hasanuddin Bapak Syaidiman menyerahkan lokasi bekas gedung MAHMILLUB kepada SMP negeri 6 Makassar untuk pengembangan sekolah yang juga beralamat di jalan A. Yani.
Tiga bulan berselang karena bapak Drs. Rajuni memasuki masa pensiun, tongkat estafet kepemimpinan diserahkan kepada bapak H. Husain sebagai kepala sekolah defenitif pertama. Dengan dibantu 30 orang Guru serta 3 orang Pegawai TU, Kepala sekolah mulai membuat SMP 6 menjadi sekolah yang patut diperhitungkan. Bersama dengan BP3 yang saat itu di ketuai oleh Bapak Daud Nompo SMP 6 mengukir prestasi demi prestasi, salah satu pengahargaan pemerintah atas prestasi yang telah dibuat SMP 6 diumur yang masih belia adalah dengan diberikannya fasilitas kepada Kepala sekolah untuk mengadakan perjalanan studi ke negeri Sakura Jepang untuk mempelajari lebih dekat perkembangan sekolah disana.
Setelah dua tahun bapak H. Husain menakodai SMP 6 Ujung pandang maka pucuk pimpinan akhirnya diserah terimakan kepada Bapak HM. Arifin. Ditangan pimpinan yang baru SMP 6 terus memperlihatkan eksistensinya sebagai sekolah yang patut diperhitungkan, Disamping peningkatan prestasi dibidang akademik dan non alademik, kedisiplinan serta hubungan sosial kemasyarakatan merupakan 3 prioritas utama misi SMP 6 kala itu.
Geliat SMP 6 Ujung pandang semakin besar ditengah persaingan antar sekolah dalam mengukir prestasi. Sampai akhirnya dengan masa jabatan 2 tahun kepemimpinan diserahkan dari bapak HM Arifin kepada bapak Robert Paat. Selain Program yang telah dicanangkan pendahulunya untuk memajukan SMP 6 Ujung pandang, Bapak Robert Paat berhasil mengkader 3 orang dari 56 orang guru yang ada pada saat itu menjadi kepala sekolah disekolah lain, mereka itu adalah: Drs. Ilyas karim, Drs. Muh. Basrah Rauf dan Drs. Abd. Rasak Karumpa.
Prestasi demi prestasi berhasil diraih SMP 6 Makassar bukan hanya tingkat kotamadya dan provinsi tapi tingkat nasional dan beberapa tingkat internasional sperti juara olimpiade dibidang IPA. Seirng dengan berjalannya waktu sekolah ini telah mengalami beberapa pergantian pimpinan dari Robert Paat, H Ranreng Pateha, Drs. H. Muin Tarham, Drs H Syamsu Alam, dan sekarang dibawah pimpinan Drs. Alimuddin Ahmad, M.Pd.
Sebagai wujud Apresiasi pemerintah atas segala presetasi sekolah ini dalam menelorkan siswa-siswa yang beprestasi, SMP 6 Makassar telah menerima beberapa predikat baik tingkat propinsi maupun tingkat Nasional.
Pada tahun 2003 SMP 6 Makassar oleh pemerintah Pusat ditunjuk Sebagai Pilot Project pelaksana terbatas kurikulum berbasis kompetensi, pada saat yang sama Sekolah ini menerima predikat sebagai Sekolah Standar Nasional dan Sekolah Koalisi nasional. Namun segala bentuk predikat yang telah diraih SMP negeri 6 makassar bukanlah hadiah yang didapat begitu saja tapi melalui beberapa tahap seleksi dan penilaian dari segala aspek. baik aspek siswa, sarana dan fasilitas, prestasi, juga dari aspek guru.